محمدباقر قاليباف در سال ۱۳۶۱ در سن ۲۱ سالگي ازدواج كرد. همسر او زهراسادات مشير، زني از  محلهٔ طرقبه است كه همسايه قاليباف بود. دوران دبيرستان را به پايان نرسانده بود كه روح‌الله خميني، صيغه عقدشان را جاري كرد. او در سازوبرگ همسرش سمت مديريت اداره فرهنگي و اجتماعي امور بانوان شهرداري تهران و مشاور شهردار را داشته است. البته بنا به ادعاي قاليباف، وي در اين پستها، حقوقي دريافت نكرده است. افزون بر آن، او شعر مي‌گويد، نقاشي مي‌كند و جامعه‌شناسي مي‌خواند. وي پس از نامزد شدن شوهرش در انتخابات رياست‌جمهوري ايران  از مديريت كل امور بانوان شهرداري تهران استعفاء داد تا در صورت انتخاب همسرش حضوري فعال در دولت وي داشته باشد.

تحصيلات
وي دانش‌آموخته رشته جغرافياي سياسي دانشگاه تهران در مقطع فوق ليسانس و دكتراي همين رشته در دانشگاه تربيت مدرس، همزمان با فرماندهي نيروي هوايي سپاه، مي‌باشد. پايان‌نامه دكتراي وي بررسي سير تكوين نهادهاي محلي ايران در دورهٔ معاصر بوده است